McCarrick a siégé au conseil d'administration de l'APSA jusqu'en 2010, année où il a dû prendre sa retraite à l'âge de 80 ans. Après 2010, McCarrick a continué à représenter la Fondazione Centesimus Annus Pro Pontifice, un groupe à but non lucratif contrôlé par l'APSA, rôle qu'il a conservé jusqu'à sa disgrâce publique à la suite de la publication des allégations d'abus sexuels en 2018.
La CNA a indiqué que le prêt de l'APSA avait été coordonné par le cardinal Angelo Becciu, alors sostituto au secrétariat d'État, et avait contrevenu aux politiques internes et aux accords réglementaires internationaux. La CNA a également annoncé qu’APSA avait finalement annulé 30 millions de ses prêts d’un montant de 50 millions d’euros.
Le prêt de l'APSA a été accordé après que la même proposition eut été refusée par l'IOR, la banque dépositaire du Vatican qui fournit des services bancaires aux ordres religieux et aux employés des curies, après que son président, Jean-Baptiste Douville de Franssu, et le cardinal George Pell, eurent opposé leur veto au plan, concluant que l'IDI serait incapable de rembourser le prêt.
La lettre de McCarrick indiquait que les informations concernant les dettes impayées de l'IDI et les antécédents de fraude et de détournement de fonds étaient « non vérifiés » et avaient "causé de graves dommages à la Fondation".
McCarrick a suggéré que les membres non professionnels du conseil d'administration s'en remettent aux membres cardinaux de la fondation pour « réparer tout dommage qui aurait pu être causé » à la crédibilité de la Fondation papale et à la demande de subvention, et « clarifier votre position ».
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Alors que les membres laïcs du conseil d'administration de la fondation étaient presque unanimes s'opposer à la demande de subvention, l'évêque et les membres cardinaux du conseil d'administration ont voté en leur faveur et, en décembre 2017, la demande de subvention a été approuvée.
Deux premiers versements du don ont été envoyés à Rome à la fin de 2017 et au début de 2018, pour un montant total de 13 millions de dollars. Après que des désaccords internes sur la subvention eurent été rendus publics, le cardinal Donald Wuerl, chargé de présenter la proposition, a déclaré qu'il demanderait au Vatican d'annuler la demande et de retourner les fonds.
Début 2019, le cardinal Pietro Parolin, secrétaire d'État du Vatican, a déclaré que les 13 millions de dollars seraient reclassés comme un prêt, plutôt que comme une subvention, et seraient remboursés au moyen de « rabais » appliqués chaque année à la liste des subventions demandées à la Fondation papale par les bureaux et apostolats catholiques du Vatican.
« Les pauvres finiront par payer la dette », a déclaré une source proche de la Fondation papale à la CNA.
Une source principale de l'APSA a blâmé la répartition de la subvention de la Fondation papale sur ce qu'il croyait être un sentiment anti François parmi les membres du conseil de la Fondation papale.
« Toutes ces objections soulevées au sujet du fait que l'IDI n'est pas comme les bénéficiaires normaux de subventions ne sont que des justifications », a-t-il déclaré à la CNA. « Si cela avait été une demande de Benoît ou de Jean-Paul II, ils auraient envoyé l'argent sans y penser. »
Lorsqu'on lui a demandé si la demande de subvention venait en fait du pape François, si le pape avait approuvé la demande ou s'il était au courant de l'objectif non divulgué de compenser le prêt de l'APSA, le fonctionnaire a répondu que c'était « sans importance ».
« En ce qui concerne la Fondation papale, si la Secrétairerie d'État le demande, c'est le pape qui demande, refuser c'est refuser le pape. »
McCarrick a été condamné par le Saint-Siège pour abus sexuel de mineurs et de séminaristes et laïcisé plus tôt cette année. McCarrick vit en isolement dans un couvent au Kansas et n'est pas disponible pour faire des commentaires.